Aufgrund anhaltender Betrugsversuche und des Missbrauchs durch Botnetze müssen sich Nutzer von RustDesk auf dem öffentlichen Server derzeit vor dem Verbindungsaufbau anmelden. Für selbst gehostete Instanzen trifft das nicht zu. Die Anmeldungspflicht gilt derzeit nur für den steuernden Rechner. Sollte der Missbrauch durch Botnetze anhalten, kann es sein, dass auch die gesteuerten Geräte eine Anmeldung erfordern. In diesem Fall müssen beide Geräte unter demselben Benutzerkonto angemeldet sein. Die Entwickler versuchen, dieses unbequeme Szenario zu vermeiden. Eventuell kommen in dem Fall Einladungslinks zum Einsatz.
Die Anmeldung ist kostenlos und kann über ein bestehendes Konto bei Google oder GitHub erfolgen. Ein separates RustDesk-Konto ist nicht erforderlich; dieses wird bei der ersten Anmeldung automatisch erstellt.
Wie auf GitHub nachzulesen ist, ist RustDesk zum Selbsthosten gedacht. Der öffentliche Server steht für Demonstrationszwecke und Tests, nicht für den Dauergebrauch, bereit. Der Server ist zudem langsam und oft gar nicht erreichbar.